环境实验教学中心实验课程体系包括基础性实验教学和综合性实验教学两个模块，前者包括无机及分析化学实验、有机化学实验、仪器分析实验、环境化学实验、环境工程原理实验、微生物学实验、生物化学与分子生物学实验、动物生物学实验等，后者有环境监测、环境工程微生物实验、生物监测实验、水污染控制工程实验、大气污染控制实验、分子生态学实验、生态学研究方法、生态毒理学实验、环境生物技术实验等。